生物發酵罐系統又稱發酵罐設備，是進行液體發酵的特殊設備，發酵罐配備有控制器和各種電極，可以自動地調控試驗所需的培養條件，是微生物學、遺傳工程、醫藥工業等科學研究所必需的設備。
控制器能夠完成基本的控制功能，它由下列幾部分構成：參數輸入及顯示裝置，用以輸入控制發酵條件的各種參數及顯示發酵過程中罐內培養液的溫度，pH、DO（溶氧）的測定數值；電極校正裝置，用以校正pH電極和DO電極等；酸堿泵，用以向發酵罐加入酸液、堿液以調節培養液中的pH；消泡劑加入泵，用以向發酵罐加入消泡劑，以消除發酵過程中產生的過多的泡沫，報警及蜂音器按鈕，當發酵過程中，電路上發生故障，如顯示屏上顯示溫度、轉速或DO值超出本機的設定值，則顯示屏上的相應值閃爍，并發出“嘟、嘟”聲。
按此按鈕則“嘟、嘟”聲可暫時消除，但只有當故障排除，蜂音器才能停止報警；自動或人工控制按鈕，用以決定本控制器是處在自動控制或人工控制狀態；電極電導連線 分別連接控制發酵罐的DO、pH、溫度、泡沫、轉速、電機啟動、加熱和冷卻；空氣調節裝置，控制器的空氣調節裝置由進氣口、出氣口、空氣減壓閥、空氣壓力表、空氣流量調節閥和空氣流量計組成，用以調節進入發酵罐的空氣流量及壓力。
發酵罐的規范操作
1.必須確保所有發酵罐單件設備能正常運行時使用本系統。
2.在消毒過濾器時，流經空氣過濾器的蒸汽壓力不得超過0.17MPa，否則過濾器濾芯會被損壞，失去過濾能力。
3.在發酵過程中，應確保罐壓不超過0.17MPa。
4.在實消過程中，夾套通蒸汽預熱時，必須控制進汽壓力在設備的工作壓力范圍內（不應超過0.2MPa），否則會引起發酵罐的損壞。
5.在空消及實消時，一定要排盡發酵罐夾套內的余水。否則可能會導致發酵罐內筒體壓扁，造成設備損壞；在實消時，還會造成冷凝水過多導致培養液被稀釋，從而無法達到工藝要求。
6.在空消、實消結束后冷卻過程中，嚴禁生物發酵罐系統內產生負壓，以免造成污染，甚至損壞設備。
7.在發酵過程中，罐壓應維持在0.03～0.05MPa之間，以免引起污染。
8.在各操作過程中，必須保持空氣管道中的壓力大于發酵罐的罐壓，否則會引起發酵罐中的液體倒流進入過濾器中，堵塞過濾器濾芯或使過濾器失效。
